分子生物学名词解释

分子生物学

• alternative splicing（选择性剪接）:
  指从一个mRNA前体中通过不同的剪接方式（选择不同的剪接位点组合）产生不同的mRNA剪接异构体的过程

• antisense strand（反义链）:
  即模板链，基因的DNA双链中，转录时作为mRNA合成模板的那条单链

• attenuator（弱化子，衰减子）:
  是指原核生物的操纵子中可以明显衰减乃至终止转录作用的一段核苷酸序列

• carboxyl terminal domain (CTD):
  RNA polⅡ最大亚基的羧基末端的重复序列片段，这是一段由羧基氨基酸为主组成的重复序列，称为羧基末端结构域

• Cis； cis-acting（顺式作用）:
  同一染色体上的DNA序列直接调控其邻近基因的表达

• Cistron（顺反子）:
  即结构基因，为决定一条多肽链合成的功能单位，约1000bp

• Domain（结构域）:
  生物大分子中具有特异结构和独立功能的区域,特别指蛋白质中这样的区域

• Domain Swap experiment（结构域交换试验）:
  把蛋白质的结构域移动来证明蛋白的结构域能被分成独立的部分

• Enhancer（强化子）:
  增加同它连锁的基因转录频率的DNA序列。通过启动子来增强转录

• Exon（外显子）:
  出现在成熟RNA中的断裂基因中的编码序列

• Gene（基因）:
  具有遗传效应的DNA片段（部分病毒如烟草花叶病毒、HIV的遗传物质是RNA）

• Genome（基因组）:
  一个生物体内所有的基因序列

• GU.………AG rule:
  多数细胞核mRNA前体中内含子的5‘边界序列为GU，3’边界序列为AG。因此，GU表示供体衔接点的5‘端，AG表示接纳体衔接点的3’端。把这种保守序列模式称为GU-AG法则

• Homeodomain（同源结构域）:
  许多反式作用因子结合DNA的结构域中具有一段相同的保守序列,是60个左右氨基酸组成的螺旋-回折-螺旋结构的区域,称为同源结构域

• Housekeeping genes（管家基因）:
  指所有细胞中均要稳定表达的一类基因，其产物是对维持细胞基本生命活动所必需的

• interupted gene（断裂基因）:
  真核生物结构基因，由若干个编码序列和非编码序列互相间隔开但又连续镶嵌而成，去除非编码序列再连接后，可翻译出由连续氨基酸组成的完整蛋白质，这些基因称为断裂基因

• Intron（内含子）:
  在一些基因的非翻译区域存在的非编码序列

• Leucine zipper（亮氨酸拉链）:
  出现在DNA结合蛋白质和其它蛋白质中的一种结构基元（motif），即模体

• Okazaki fragments（冈崎片段）:
  相对比较短的DNA链（大约1000核苷酸残基），是在DNA的后滞链的不连续合成期间生成的片段

• Operon（操纵子）:
  操纵子（operon）：指启动基因、操纵基因和一系列紧密连锁的结构基因的总称。转录的功能单位

• overlapping gene（重叠基因）:
  一个基因是另外一个基因的一部分

• promoter（启动子）:
  RNA聚合酶特异性识别和结合的DNA序列启动子是基因（gene）的一个组成部分，控制基因表达（转录）的起始时间和表达的程度

• protein folding:
  蛋白质会由所含氨基酸残基的亲水性、疏水性、带正电、带负电等特性通过残基间的相互作用而折叠成一立体的三级结构

• Proteome（蛋白质组）:
  一个生物体所合成的蛋白质总量

• pseudogene（假基因）:
  与正常基因相似，但丧失正常功能的DNA序列，往往存在于真核生物的多基因家族中，基因组中与编码基因序列非常相似的非功能性基因组 DNA 拷贝,一般情况都不被转录,且没有明确生理意义

• Nucleotide（核苷酸）:
  一类由嘌呤碱或嘧啶碱、核糖或脱氧核糖以及磷酸三种物质组成的化合物

• replicon（复制子）:
  DNA复制时从一个DNA复制起点开始，最终由这个起点起始的复制叉完成的片段

• repressor（阻遏物）:
  与DNA或RNA结合来阻止转录或翻译的一类蛋白质

• Rho-dependant termination（ρ蛋白依赖型终止）:
  蛋白结合在正在延伸的RNA链上并沿5'-3'移动，像是追着RNA聚合酶，当聚合酶在终止序列减速或停顿时，会追上聚合酶并将新生的RNA链拉离转录泡

• ribozyme（核酶）:
  具有催化功能的RNA分子，是生物催化剂，可降解特异的mRNA序列

• RNA editing（RNA编辑）:
  指一种在核糖核酸（RNA）由聚合酶生成之后其转录自脱氧核糖核酸（DNA）的核酸序列又发生改变的分子生物学过程。和其它转录后修饰方式（如RNA剪接、5'加帽、3'加尾）相比，RNA编辑现象相对较为罕见。RNA编辑通常包括碱基的插入、丢失和替换

• RNA splicing（RNA剪接）:
  剪切RNA中对应内含子的序列，并让RNA中对应外显子的序列接合成连续的mRNA

• RNP:
  RNA和蛋白质的复合体

• rolling circle replication（滚环复制）:
  一条环状亲本DNA链保持完整状态并滚环或在合成新的互补链的时候作为模板滚动

• Secondary structure（二级结构）:
  指一个生物巨分子，如蛋白质及核酸（DNA或RNA），局部区段的三维通式

• self-conservative replication（半保留复制）:
  DNA复制的过程中，亲本双螺旋中的每一条链都被保留下来，即双螺旋的一般被保留

• Semidiscontinuous replication（半不连续复制）:
  DNA复制过程中，一条链先连续合成（先导链），另一条链通过短片段合成的方式进行延伸，是不连续合成的（滞后链）

• Shine-Dalgarno(S-D) sequence（SD序列）:
  mRNA中用于结合原核生物核糖体的序列。

• Ribosome Binding Site （核糖体结合位点）:
  mRNA的起始AUG上游约8~13核苷酸处。存在一段由4~9个核苷酸组成的共有序列-AGGAGG-，可被16SrRNA通过碱基互补精确识别。这段序列被称为核糖体结合位点

• spliceosome（剪接体）:
  指进行RNA剪接时形成的多组分复合物，其大小为60S，主要是由小分子的核RNA和蛋白质组成

• Trans； trans-acting（反式作用）:
  是指能直接或间接地识别或结合在各类顺式作用元件核心序列上参与调控靶基因转录效率的蛋白质。有时也称转录因子。大多数真核转录调节因子由某一基因表达后，可通过另一基因的特异的顺式作用元件相互作用，从而激活另一基因的转录。这种调节蛋白称反式作用因子。

• Transcription activation domains（转录激活区域）:
  详见PPT

• Transcription bubble（转录泡）:
  转录时进行RNA合成的区域DNA呈局部解旋状态，形状像一个“气泡”，称为转录泡

• Transposon（转座子）:
  可以将自身插入基因组中一个（和自身没有任何关联的）新位点的DNA序列

• Nuclear location signal（NLS）:
  核内含量丰富的核质蛋白的C端有一个信号序列，可引导蛋白质进入细胞核，称作核定位信号

• Upstream regulatory elements（上游调控元件）:
  详见PPT

• zinc finger domain（锌指结构区域）:
  锌指结构指的是在很多蛋白中存在的一类具有指状结构的模体，这些具有锌指结构的蛋白大多都是与基因表达的调控有关的功能蛋白