HJ63. DNA序列

刷题

题目：一个 DNA 序列由 A/C/G/T 四个字母的排列组合组成。 G 和 C 的比例（定义为 GC-Ratio ）是序列中 G 和 C 两个字母的总的出现次数除以总的字母数目（也就是序列长度）。在基因工程中，这个比例非常重要。因为高的 GC-Ratio 可能是基因的起始点。
给定一个很长的 DNA 序列，以及限定的子串长度 N ，请帮助研究人员在给出的 DNA 序列中从左往右找出 GC-Ratio 最高且长度为 N 的第一个子串。
DNA序列为 ACGT 的子串有: ACG , CG , CGT 等等，但是没有 AGT ， CT 等等
数据范围：字符串长度满足 1≤n≤1000 ，输入的字符串只包含 A/C/G/T 字母

输入描述：输入一个string型基因序列，和int型子串的长度
输出描述：找出GC比例最高的子串,如果有多个则输出第一个的子串
示例1

输入：ACGT
     2
输出：CG
说明：ACGT长度为2的子串有AC,CG,GT3个，其中AC和GT2个的GC-Ratio都为0.5，CG为1，故输出CG

示例2

输入：AACTGTGCACGACCTGA
     5
输出：GCACG
说明：虽然CGACC的GC-Ratio也是最高，但它是从左往右找到的GC-Ratio最高的第2个子串，所以只能输出GCACG。

链接：https://www.nowcoder.com/practice/e8480ed7501640709354db1cc4ffd42a

public class Main {
    public static void main(String[] args){
        Scanner sc = new Scanner(System.in);
        while(sc.hasNext()){
            String s = sc.next();
            int n = sc.nextInt();
            String[] subStr = new String[]{"ACG", "CG", "CGT"};
            int count = 0;
            String maxSubstring = null;
            //滑动窗口，窗口大小n
            for (int i=0; i<s.length()-n+1; i++) {
                String sub = s.substring(i, i+n);
                for (String s1 : subStr) {
                    if(!sub.contains(s1)) continue;
                    int ratio = countGcRatio(sub);
                    if (ratio > count) {
                        count = ratio;
                        maxSubstring = sub;
                        break;
                    }
                }
            }
            System.out.println(maxSubstring);
        }
    }
    //字符串大小固定，只统计'C'、'G'的数量
    private static int countGcRatio(String s) {
        int ratio = 0;
        for (int i = 0; i < s.length(); i++) {
            char c = s.charAt(i);
            if (c=='C' || c=='G') ratio++;
        }
        return ratio;
    }
}